ห้องผ่าตัดจะต้องแบ่งอย่างเคร่งครัดเป็นพื้นที่หวงห้าม (ห้องผ่าตัดปลอดเชื้อ) พื้นที่กึ่งจำกัด- (ห้องผ่าตัดที่มีการปนเปื้อน) และพื้นที่ไม่จำกัด มีสองการออกแบบสำหรับการแยกโซนทั้งสามนี้ แบบแรกคือการวางพื้นที่หวงห้ามและกึ่งหวงห้าม-ไว้บนชั้นต่างๆ ซึ่งช่วยให้สามารถแยกส่วนตามสุขอนามัยได้อย่างทั่วถึง แต่ต้องใช้สิ่งอำนวยความสะดวกสองชุด เพิ่มพนักงาน และไม่สะดวกสำหรับการจัดการ อีกประการหนึ่งคือต้องมีพื้นที่หวงห้ามและไม่จำกัดในส่วนต่างๆ ของชั้นเดียวกัน โดยมีพื้นที่กึ่งหวงห้ามอยู่ระหว่างนั้น และใช้อุปกรณ์ร่วมกัน การออกแบบนี้สะดวกกว่าสำหรับการจัดการ
พื้นที่หวงห้าม ได้แก่ ห้องผ่าตัดปลอดเชื้อ ห้องน้ำ ห้องปลอดเชื้อ และห้องเก็บยา พื้นที่กึ่งจำกัด- ได้แก่ ห้องผ่าตัดฉุกเฉินหรือที่มีการปนเปื้อน ห้องเตรียมเครื่องมือและห้องแต่งตัว ห้องเตรียมยาระงับความรู้สึก และห้องฆ่าเชื้อ พื้นที่ไม่จำกัด ได้แก่ ห้องเปลี่ยนเสื้อผ้า ห้องปูน ห้องตัวอย่าง ห้องกำจัดของเสีย ห้องพักฟื้นยาสลบ ห้องพยาบาล ห้องพักผ่อนของพนักงาน ห้องรับประทานอาหาร และห้องน้ำสำหรับครอบครัวผู้ป่วยศัลยกรรม ห้องปฏิบัติหน้าที่และห้องพยาบาลควรตั้งอยู่ใกล้ทางเข้า